OpenCGChromatin 近原子级模拟揭示染色质结构与相分离的分子机制

OpenCGChromatin 高性能粗粒化模型实现近原子级染色质模拟，规模比此前大一个数量级，可覆盖数十 kb 的纤维与生物分子凝聚体。该模型从物理化学原理独立预测了冷冻电镜观察到的连接 DNA 依赖性染色质结构，并揭示组蛋白尾部动力学与相互作用网络。模拟 108 核小体纤维显示，乙酰化以模式特异性方式破坏染色质压缩，其中 H4K16 与 H3K9 修饰的能量破坏作用最强。